Programme préliminaire de la rencontre

Note : Le programme sera sujet à de légères modifications au fur et à mesure que les inscriptions et les conférenciers seront confirmés.

Jour 0 — Lundi 6 juillet : Ateliers d'ouverture & Réseautage social

Arrivée des participants
14 h 00–15 h 00 Mot de bienvenue / Discours d'ouverture
Comité organisateur de la conférence
Accueil et présentation de la rencontre ZAMBI.
15 h 00–17 h 30 Ateliers de formation en parallèle
Gestion des données de recherche (Robert Beiko | Ben Fisher)
S'assurer que vos données sont FAIR (Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables et Réutilisables) est essentiel dans l'environnement de recherche actuel orienté vers les données. Cet atelier vous présentera les outils et techniques de la gestion des données de recherche (GDR) pour gérer les données et garantir la reproductibilité. Vous apprendrez la théorie et la mise en œuvre technique de la GDR à travers une combinaison de cours magistraux animés par des experts et d'exercices pratiques en laboratoire. L'atelier couvrira les fondements de la GDR, le contrôle de version, l'actionnabilité machine et la découverte de données.
Comment effectuer une évaluation par les pairs (Zhenyu Cheng | Shannen Grandy)
L'évaluation par les pairs est une compétence essentielle pour s'engager de manière critique avec la littérature scientifique et améliorer sa propre écriture. Les stagiaires recevront un cours sur la façon de conduire l'évaluation d'un manuscrit, puis auront l'occasion de travailler en petits groupes pour évaluer une prépublication de BioRxiv. À la fin de la session, les critiques de tous les groupes seront compilées et résumées dans un document d'évaluation par les pairs par les animateurs de la session et publiées sur zenodo.
19 h 00–21 h 30 Événement de réseautage éclair & Dîner social
Un événement de réseautage où les stagiaires font la rotation en petits groupes autour de tables animées par des mentors, permettant des conversations ciblées et des connexions diversifiées dans un format structuré. Cet événement sera suivi d'un dîner social informel, offrant aux participants l'occasion de réseauter dans un cadre plus détendu.

Jour 1 — Mardi 7 juillet

9 h 00–10 h 00 Accueil & Conférence plénière d'ouverture
Andrew Lang

Andrew Lang

Université Memorial de Terre-Neuve — Biologie

Andrew Lang a obtenu un baccalauréat spécialisé (avec mention) en biochimie de l'Université Brock en 1994, suivi d'un doctorat en microbiologie de l'Université de la Colombie-Britannique en 2000. Après des stages postdoctoraux à l'UBC et à l'Université de l'Alaska à Fairbanks, il a rejoint le Département de biologie de l'Université Memorial de Terre-Neuve en 2006. Son laboratoire de recherche étudie divers sujets en microbiologie. Un axe principal est la microbiologie de la faune sauvage, qui comprend l'étude des virus de l'influenza aviaire et des Escherichia coli résistants aux antimicrobiens chez les oiseaux sauvages.

Rôles des oiseaux sauvages dans la dissémination des zoonoses virales et des bactéries résistantes aux antimicrobiens

Résumé

Dans cette présentation, je me concentrerai sur les oiseaux sauvages et leur rôle dans la circulation et la dissémination des virus de l'influenza aviaire hautement pathogènes et des Escherichia coli résistants aux antimicrobiens. À partir de fin 2021, des introductions répétées de virus d'influenza aviaire hautement pathogènes H5 en Amérique du Nord depuis l'Eurasie ont eu lieu via les routes Pacifique et Atlantique. Une introduction concernait une souche H5N5, connue sous le nom de A6, détectée pour la première fois à Terre-Neuve en 2023, puis dispersée dans tout le Canada atlantique et au Québec, avec une proportion notable d'infections détectées chez les mammifères terrestres. Cette souche a semblé passer largement inaperçue ailleurs avant de causer un décès humain dans l'État de Washington en novembre 2025. En plus des zoonoses virales, la faune sauvage est aussi un réservoir de bactéries résistantes aux antimicrobiens. Nous avons utilisé une approche basée sur la culture pour isoler des E. coli résistants aux antimicrobiens chez des oiseaux sauvages à Terre-Neuve, suivie d'une caractérisation phénotypique et génomique des souches isolées. Dans l'ensemble, les oiseaux sauvages de cette région se sont avérés être des réservoirs d'E. coli génétiquement diversifiés, résistants aux antimicrobiens et potentiellement pathogènes. Les souches isolées chez des oiseaux ayant un usage plus important d'environnements anthropisés étaient plus diversifiées, présentaient des taux de résistance plus élevés et résistaient à davantage de composés que celles provenant d'oiseaux utilisant des environnements plus préservés. Les espèces d'oiseaux étudiées effectuent des déplacements locaux et migratoires importants et servent probablement de vecteurs importants pour la dissémination de ces bactéries à grande échelle géographique.

10 h 00–10 h 30 Pause café et thé
10 h 30–12 h 00 Présentations de recherche sur l'évolution
Conférencier 1 (30 min), Conférencier 2 (30 min), Conférencier 3 (30 min)
Présentations de recherche sélectionnées de professeurs et de stagiaires expérimentés sur des sujets liés à l'évolution des pathogènes, la phylogénétique et les approches computationnelles en One Health.
12 h 00–13 h 00 Déjeuner
13 h 00–14 h 00 Présentations méthodologiques
Conférencier 1 (30 min), Conférencier 2 (30 min)
Présentations sélectionnées et invitées axées sur l'explication des méthodologies, des outils et des ressources disponibles.
14 h 00–14 h 30 Pause café et thé
14 h 30–16 h 00 Sessions parallèles
Session A : 5 conférenciers (18 min chacun) | Session B : 5 conférenciers (18 min chacun)
Présentations sélectionnées de stagiaires dans 2 volets parallèles.
16 h 00–17 h 00 Conférence plénière du soir
Jennifer Geddes-McAlister

Jennifer Geddes-McAlister

Université de Guelph — Biologie moléculaire & cellulaire

La Dre Jennifer Geddes-McAlister est titulaire de la Chaire de recherche du Canada en protéomique des maladies fongiques en One Health et professeure agrégée. Son programme de recherche innovant et interdisciplinaire applique la protéomique de pointe par spectrométrie de masse et la biologie computationnelle pour lutter contre les maladies fongiques selon quatre axes : i) prévention, ii) diagnostic, iii) surveillance, et iv) traitement, pour améliorer la santé mondiale. La Dre Geddes-McAlister est reconnue comme chef de file mondiale en protéomique et en recherche sur les maladies infectieuses avec plus de 100 publications, son élection à la Société royale du Canada – Collège des nouveaux chercheurs, artistes et scientifiques, sept prix de début de carrière, un prix d'excellence des anciens et des prix nationaux et internationaux de mentorat. Elle est présidente du Réseau national canadien de protéomique, vice-présidente de l'Organisation du protéome humain, cofondatrice du Consortium canadien d'intelligence artificielle et de spectrométrie de masse pour la biologie des systèmes (CAN-AIMS), rédactrice associée du Journal of Proteome Research, secrétariat de l'Association Humboldt du Canada, et fondatrice de « Moms in Proteomics », une initiative internationale dédiée à la reconnaissance et au soutien des mères en STIM.

Des spectres aux solutions : la protéomique à l'avant-garde de l'infection fongique, de l'immunité et de la résilience

Résumé

Les maladies fongiques affectent des millions de personnes dans le monde, allant d'infections superficielles à des infections systémiques. Les options thérapeutiques contre les maladies fongiques sont limitées en raison de l'émergence de nouveaux pathogènes à résistance intrinsèque et d'une évolution accrue vers des souches résistantes. Pour lutter efficacement contre les maladies fongiques, mon équipe de recherche exploite la puissance de pointe de la protéomique par spectrométrie de masse intégrée à la bioinformatique avancée. En identifiant les facteurs protéiques des maladies fongiques, nous pouvons apporter de nouvelles perspectives biologiques selon quatre axes de recherche : i) prévention, ii) diagnostic, iii) surveillance, et iv) traitement. Pour la prévention, nous perturbons des protéines et des voies critiques pour affaiblir le pathogène et prévenir l'infection ; pour le diagnostic, nous définissons des signatures de production protéique à double perspective — couvrant à la fois l'hôte et le pathogène — dans les dimensions spatiales et temporelles pour permettre des insights diagnostiques et pronostiques précis. Pour la surveillance et le traitement, nous explorons les interactions hôte-pathogène au niveau protéique, découvrant de nouvelles cibles médicamentales essentielles à l'innovation thérapeutique, et nous combattons la résistance antifongique par ciblage protéique pour restaurer l'efficacité des médicaments antifongiques existants. Ensemble, notre approche intégrée axée sur la protéomique offre des solutions transformatrices à la gestion des maladies fongiques avec pour objectif de faire progresser les initiatives de santé mondiale.

19 h 00–21 h 00 Session de posters
Présentations de posters en soirée.

Jour 2 — Mercredi 8 juillet

9 h 00–10 h 00 Conférence plénière d'ouverture
Natalie Diether

Natalie Diether

Université Dalhousie — Agriculture

La Dre Diether est professeure adjointe au Département des sciences animales et de l'aquaculture de l'Université Dalhousie. Son programme de recherche est axé sur la fonction du microbiote intestinal et du métabolisme microbien dans la santé des animaux de production. Ses travaux mettent l'accent sur des stratégies et des interventions alimentaires fondées sur des mécanismes qui répondent aux défis liés à la santé, à la productivité et à la durabilité, réduisant ainsi la dépendance aux antimicrobiens. La Dre Diether a obtenu son doctorat en sciences animales de l'Université de l'Alberta en 2023, après une maîtrise et un baccalauréat en agriculture (sciences animales). Sa recherche doctorale a utilisé des techniques multi-omiques pour étudier comment les composants alimentaires façonnent le métabolisme microbien intestinal et les réponses physiologiques de l'hôte chez les porcelets sevrés. Après son doctorat, elle a travaillé comme agente de programme de recherche pour Results Driven Agriculture Research avant de rejoindre Dalhousie en 2024.

Du laboratoire à l'étable : cibler les métabolites microbiens intestinaux comme alternatives aux antibiotiques

Résumé

10 h 00–10 h 30 Pause café et thé
10 h 30–12 h 00 Présentations de recherche en écologie microbienne et microbiome
Conférencier 1 (30 min), Conférencier 2 (30 min), Conférencier 3 (30 min)
Présentations de recherche sélectionnées de professeurs et de stagiaires expérimentés sur des sujets liés au séquençage environnemental, à l'ADNe, à l'écologie des communautés et à la recherche sur le microbiome.
12 h 00–12 h 45 Déjeuner
12 h 45–13 h 45 Présentations méthodologiques
Conférencier 1 (30 min), Conférencier 2 (30 min)
Présentations sélectionnées et invitées axées sur l'explication des méthodologies, des outils et des ressources disponibles.
Campus agricole et dîner de la conférence (facultatif)

14 h 00–15 h 30 : Bus vers le campus agricole de Dalhousie

15 h 30–19 h 00 : Visites de biosécurité agricole, conférences & rafraîchissements

15 h 30–19 h 00 : Gestion des éclosions en pratique : leçons apprises sur l'IAHP chez la volaille

19 h 00–21 h 00 : Dîner de la conférence

21 h 00–22 h 00 : Bus de retour vers Halifax

Le campus agricole de Dalhousie à Bible Hill comprend une ferme de recherche en exploitation. Les participants vivront une expérience concrète de la biosécurité en conditions réelles grâce à des visites guidées et des conférences d'experts qui font le lien entre théorie et pratique. L'excursion se conclut par notre dîner de la conférence mettant en valeur les produits agricoles locaux, célébrant le lien entre l'agriculture durable et la recherche One Health.

Inscription séparée requise — Après-midi/soirée libre pour les non-inscrits.

Jour 3 — Jeudi 9 juillet

9 h 00–10 h 00 Conférence plénière d'ouverture
Maureen Murray

Maureen Murray

Lincoln Park Zoo — Urban Wildlife Institute

La Dre Maureen Murray est directrice adjointe de One Health à l'Urban Wildlife Institute du Lincoln Park Zoo de Chicago. Elle combine les sciences sociales et l'écologie des maladies de la faune sauvage pour comprendre les impacts sanitaires des interactions humains-faune afin de promouvoir la santé publique et la biodiversité dans les villes.

Le projet Chicago Rat : une approche One Health pour comprendre les facteurs de la leptospirose urbaine

Résumé

La leptospirose, une maladie fatale associée aux rats, est la zoonose la plus répandue sur Terre et pourrait être en augmentation avec les changements mondiaux en matière d'urbanisation et de climat. Bien que la leptospirose soit relativement rare en Amérique du Nord, en 2025, une alerte sanitaire a été émise à Chicago, la « ville la plus infestée de rats en Amérique » de 2015 à 2025. Dans cette conférence, je présenterai diverses études sur le risque de leptospirose dans le cadre du Chicago Rat Project, un effort interdisciplinaire visant à comprendre les communautés vulnérables et les stratégies d'atténuation des maladies. Cette approche a révélé des facteurs environnementaux et de gestion associés à l'infection chez les rats ainsi que des facteurs sociaux associés au risque humain. À travers ces projets, je partagerai les leçons apprises sur les avantages d'une approche One Health avec des partenariats multisectoriels pour créer des villes plus saines pour les personnes et la faune sauvage.

10 h 00–10 h 30 Pause café et thé
10 h 30–12 h 00 Présentations de recherche One Health appliqué
Conférencier 1 (30 min), Conférencier 2 (30 min), Conférencier 3 (30 min)
Amy Gillgrass

Amy Gillgrass

Université Dalhousie

Amy Gillgrass est professeure adjointe au Département de microbiologie et immunologie qui a rejoint l'Université Dalhousie en 2025. La Dre Gillgrass a obtenu son doctorat de l'Université McMaster et a travaillé plusieurs années dans la biotechnologie chez Turnstone Biologics avant de créer son laboratoire à l'Université McMaster (2019). La recherche de la Dre Gillgrass est axée sur l'utilisation de modèles de souris humanisées de nouvelle génération pour étudier les maladies infectieuses et le cancer. À l'aide de ces souris, le laboratoire de la Dre Gillgrass a établi des modèles du VIH, de la tuberculose et de la co-infection VIH/TB pour explorer la pathogenèse, les traitements et la vaccination dans le contexte des cellules immunitaires humaines. Compte tenu de la nature innovante de son programme, la Dre Gillgrass a reçu le prix de recherche de début de carrière E.J. Moran Campbell et le prix Bhagirath Singh de début de carrière en infection et immunité des IRSC.

Étude des réponses immunitaires dans les maladies infectieuses et la vaccination à l'aide de modèles de souris humanisées de nouvelle génération

Résumé

La tuberculose (TB), causée par Mycobacterium tuberculosis (Mtb), est la première maladie infectieuse mortelle et la cause de décès la plus fréquente chez les personnes vivant avec le VIH (PVVIH). La co-infection VIH et TB impose un fardeau immense sur les systèmes de santé car ils agissent en synergie pour aggraver mutuellement leurs pronostics. Un autre facteur compliquant la prise en charge de la TB est la prévalence croissante de la TB multirésistante et ultrarésistante (MR/UR). Bien que le VIH et la TB soient endémiques en Afrique subsaharienne, ils affectent également de manière disproportionnée les populations marginalisées au Canada. Malheureusement, le seul vaccin contre la TB homologué, le BCG, ne protège pas contre la TB pulmonaire de l'adulte et n'est pas recommandé pour les PVVIH. La meilleure façon de prévenir l'émergence de la TB MR/UR est de développer de nouveaux vaccins efficaces contre la TB, sûrs et efficaces pour les personnes à haut risque. Les souris humanisées de nouvelle génération sont des modèles idéaux pour cette recherche car elles reproduisent une réponse immunitaire humaine plus complète et peuvent être infectées avec succès par le VIH, la TB et le VIH/TB. Nous avons constaté qu'elles reproduisent de nombreux aspects de la pathologie humaine du VIH et de la TB. Nous avons étudié l'immunogénicité et l'efficacité protectrice d'un vaccin trivalent de nouvelle génération à vecteur adénoviral de chimpanzé mucosal respiratoire (Tri:ChAd:TB) chez des souris humanisées naïves et infectées par le VIH. Lors de l'immunisation de souris naïves, une tendance à l'augmentation des cellules T CD4+ spécifiques de Mtb produisant de l'IFNγ et du TNFα dans les poumons et la rate a été observée. Les souris humanisées vaccinées et exposées à Mtb ont présenté une réduction significative de la charge mycobactérienne pulmonaire, une diminution de la dissémination tissulaire et une amélioration de la pathologie pulmonaire. Les souris infectées par le VIH, puis immunisées et exposées à Mtb, ont présenté une tendance à la diminution de la charge mycobactérienne dans les poumons par rapport aux souris non vaccinées, indiquant que le vaccin pourrait offrir une protection contre la TB, même dans le contexte d'une infection par le VIH. Ces résultats démontrent l'efficacité du vaccin mucosal respiratoire Tri:ChAd:TB et pourraient enrayer cette épidémie mondiale en prévenant l'émergence de la TB MR/UR.

Amy Lee

Amy Lee

Université Simon Fraser

La Dre Lee a rejoint le Département de biologie moléculaire et biochimie de l'Université Simon Fraser comme professeure adjointe en 2020. Elle a complété son doctorat en biologie cellulaire et systèmes à l'Université de Toronto avec les Drs David Guttman et Darrell Desveaux, étudiant la course aux armements évolutive entre l'hôte et les pathogènes. Cela a été suivi de deux bourses postdoctorales à l'Université de la Colombie-Britannique (UBC), d'abord avec le Dr Nislow, appliquant la génomique bactérienne comparative et la phénomique pour étudier l'adaptation bactérienne dans les infections persistantes. Elle a ensuite travaillé avec le Dr Bob Hancock en appliquant l'immunologie et la vaccinologie des systèmes pour comprendre le développement immunitaire néonatal. Elle est lauréate du prix Banting Discovery et boursière MSFHR. Sa recherche actuelle utilise des approches de biologie des systèmes pour améliorer le diagnostic de la septicémie néonatale et lutter contre la résistance aux antimicrobiens.

Lutter contre la septicémie néonatale — une stratégie de biologie des systèmes et One Health pour une crise de santé mondiale

Résumé

Chaque année, environ trois millions de nouveau-nés meurent de septicémie dans le monde, avec environ 75 % de tous les décès chez les moins de cinq ans survenant dans la première semaine de vie. La septicémie est une préoccupation mondiale, en particulier pour les jeunes nourrissons qui sont les plus à risque de mortalité. Cependant, il n'existe pas de moyen rapide et fiable d'identifier les microbes infectieux, ce qui entraîne un sur- ou sous-traitement des bébés aux antibiotiques, pouvant contribuer à la résistance et à l'épuisement des ressources limitées. Pour relever ce défi, notre groupe applique des approches de biologie des systèmes et des analyses omiques avancées dans un contexte de santé mondiale pour : (1) définir des marqueurs moléculaires de l'hôte dans la septicémie bactérienne à l'aide d'analyses transcriptomiques à l'échelle du génome et de l'apprentissage automatique ; (2) identifier des facteurs de virulence potentiels dans les agents bactériens causaux par des études d'association à l'échelle du génome microbien ; et (3) appliquer le séquençage 16S Nanopore à longue lecture de pointe pour développer des vaccins et améliorer l'identification des agents pathogènes. En fin de compte, notre objectif est de comprendre pourquoi les nouveau-nés sont très vulnérables aux infections durant leur première semaine de vie, et d'appliquer des stratégies omiques avancées pour développer des applications concrètes, notamment des vaccins, des outils diagnostiques et des traitements.

12 h 00–13 h 00 Déjeuner
13 h 00–14 h 00 Présentations de recherche
Scott Weese

Scott Weese

Université de Guelph — Ontario Veterinary College

Le Dr Weese est interniste vétérinaire et professeur à l'Ontario Veterinary College de l'Université de Guelph, directeur du Centre de santé publique et de zoonoses de l'Université de Guelph, chef du contrôle des infections au Centre des sciences de la santé de l'Ontario Veterinary College. Il est président du Groupe consultatif de l'OMS sur les antimicrobiens d'importance critique en médecine humaine, membre du Groupe consultatif du gouvernement du Canada sur la RAM, de la plateforme de partenariat multipartite sur la RAM du quadripartisme et du Comité consultatif scientifique sur les urgences de santé publique de l'Ontario, et ancien membre du Groupe de leaders mondiaux du quadripartisme sur la RAM. Il gère également le site web sur les maladies infectieuses WormsAndGermsBlog.

Lignes directrices et listes sur l'utilisation des antimicrobiens et leur impact sur la gestion et la surveillance

Résumé

Cette présentation exposera les principaux systèmes et listes de classement, de priorisation et de catégorisation des médicaments antimicrobiens, en mettant l'accent sur leurs objectifs, leurs lacunes et la façon dont ils peuvent être utilisés pour appuyer les activités de gestion et de surveillance.

14 h 00–14 h 30 Pause café et thé
14 h 30–16 h 00 Sessions parallèles
Session A : 5 conférenciers (18 min chacun) | Session B : 5 conférenciers (18 min chacun)
Présentations sélectionnées de stagiaires dans 2 volets parallèles.
16 h 00–16 h 30 Pause thé
16 h 30–18 h 30 Exercice de simulation d'intervention en cas d'éclosion
Organisateur : Finlay Maguire
Ce tutoriel/exercice de table présentera un scénario d'éclosion débutant avec un petit nombre de cas initiaux sans agent infectieux connu. En combinant des données contextuelles et des approches contemporaines d'investigation en santé publique génomique, nous identifierons l'agent pathogène, les événements à haut risque, et développerons une stratégie de surveillance pour le suivi de l'éclosion.
19 h 30–21 h 30 Session de posters et réception de clôture
Présentations finales de posters et réception de clôture.